同室操戈，这是天下大不幸之事，不管大掌教胜利也好，还是皇帝胜利也罢，都快点结束罢。”
还有就是比较无所谓的，给谁干不是干，只要有功名有太平钱，在哪里干都行。
这些思想问题是必须要解决的。
为了尽快把这些俘虏人员从累赘改造为道门的军队，苏元载从江南道府又调来三百余道士，开始“掺沙子”，担任重要职位。部分愿意合作的被俘军官、道士予以留任，多是担任相应副职，协助工作。
对于部分反对投降、冥顽不灵、不思悔改之人，则进行了清洗，严重者直接处决，以儆效尤。其他人的最终归宿将是南洋、罗娑洲、昆仑道府，甚至是南大陆。
对接受改编的俘虏进行教育，清除他们脑中的忠君思想，树立忠于道门的正确思想。派专人上大课，讲解如今的战争形势和道门方面的节节胜利，讲解秦李集团失败的必然性，讲述道门正统性和大一统的正确性，使被俘人员认清形势，放下负担，打消顾虑，走到正确的道路上来。
在这方面，也需要被俘将领的主动配合，被俘将领的威望越高，那么配合的效果也就越好。
所以苏元载同时对黑衣人进行了改制。
随着改编黑衣人越来越多，由慈航真人和宁凌阁联合制定了新军制，备注：试行。
如果是出动几十万大军的战事，那么道门的最高职务还是掌军真人或者掌军大真人，这一点不会改变，这个职务也不常设，要经过金阙议事才会正式设立，战毕撤销，道门称之为“挂帅”。
这次战事，就是天师亲自挂帅，以副掌教大真人的身份担任掌军大真人。
在掌军真人之下设“军”。一军最高指挥官为提督军务总兵官，副手为协理军务总兵官，一军平均在五万人左右。
“军”之下设“镇”，一军下辖三个镇，一镇最高指挥官为镇守总兵官，副手为协理镇守总兵官，一镇平均在一万五千人左右。
“镇”之下设“协”，一镇下辖三个协，一协最高指挥官为协守总兵官，副手为协理协守总兵官，一协大概在四千人左右。
每一级单位刚好与其指挥官的称呼相对应，即：提督军务的军、镇守的镇、协守的协。
在“协”之下设“标”，在“标”之下设“营”，在“营”之下设“队”，队分三级：大队、中队、小队。
这便是道门改革之后的新军制，经过金阙的审核和大掌教的批准之后，已经正式启用。
苏
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