最大的争议之一，在于是否设立“事前审查”（送审制）。 以孔颖达、来俊臣为代表的保守和严厉派，强烈要求对所有民间出版物实行刊印前送官府审查，合格后方可刊行，认为这样才能“防患于未然”。而以魏元忠、裴行俭及李瑾为代表的一方，则坚决反对，认为这在实际中不可行（审查量巨大，且会严重拖延信息流通，窒息文化活力），且极易导致权力寻租和思想禁锢。狄仁杰居中调和，最终采取了折中方案：对普通书籍、小报，实行登记备案和事后追惩；但对涉及“核心禁区”和“伦理红线”中特别敏感内容（如涉及皇室、高层官员、重大军事、宗教教义争议）的书籍，或首次登记的新办报刊，官府有权要求其提交样本进行“重点查看”，但需在十日内给出明确意见，否则视为无异议。 这实际是一种有限的、有条件的事前干预，而非普遍审查。
另一个争议是关于“公藏图书馆”的藏书标准。 孔颖达等人要求严格审查，凡不符合“正道”的书籍一律不得入藏，甚至要求清理现有“问题”藏书。裴行俭、魏元忠及代表“格物院”参与讨论的沈括等人则主张，公藏图书馆应以“广博收藏，兼容并蓄，但分级管理”为原则，可设“公开阅览区”（放置经史子集、朝廷认可的典籍、有益教化的通俗读物）和“特许阅览区”（存放有争议但有一定学术价值，或涉及专业知识的书籍，需有一定功名、或经特许方可查阅）。最终采纳了分级管理方案，但“特许阅览区”的准入标准制定权，交给了礼部和国子监，这为保守势力留下了一定控制空间。
历时近两个月，草案十易其稿，争论、妥协、修改，字斟句酌。 每一处改动，都牵动着朝野不同派系的神经。草案文本在极小范围内流传，引发了各种猜测和暗中的游说、施压。
终于，在一个雪后初晴的早晨，最终定稿的《神都律·出版及言论条格》（为彰显权威，并入《神都律》体系）草案，连同详细的立法说明和争议焦点备忘，被呈送到了武则天的御案前。
紫宸殿内，炭火融融。武则天仔细翻阅着这部厚达数十页的律法草案。她的目光掠过那些严谨乃至苛刻的禁止条款，也审视着那些为“学术探讨”、“文艺创作”、“实学传播”留下的狭窄缝隙和复杂但书。她看到了狄仁杰竭力维持的平衡，看到了李瑾试图引导的方向，也看到了条文背后各方势力的角力痕迹。
“狄卿辛苦了。” 武则天放下草案，缓缓道，“此律法，可谓宽严相济，疏堵并举。既有雷霆手段，以儆效尤；亦存菩萨心肠，网开
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